Una ayuda europea impulsa un software para detectar cáncer desarrollado en la Universidad de Navarra y basado en análisis genético avanzado.
Eva Marabotto
Investigadores de la Universidad de Navarra han creado RNACOREX. Es un software de código abierto para detectar cáncer. Además, analiza grandes volúmenes de datos genéticos de forma simultánea.
La herramienta nace en el Instituto DATAI. El equipo forma parte del Cancer Center Clínica Universidad de Navarra. El estudio se ha publicado en PLOS Computational Biology.
RNACOREX ya se ha probado con éxito. Para ello, se usaron datos de trece tumores distintos. Los datos proceden del consorcio internacional The Cancer Genome Atlas.
Cómo funciona RNACOREX
Dentro de las células existen redes genéticas complejas. Cuando fallan, pueden aparecer tumores. “Comprender cómo se organizan estas redes es clave”, explica Rubén Armañanzas.
El problema es la cantidad de información disponible. También influyen las señales falsas. Por eso, RNACOREX combina bases de datos internacionales con datos reales.
Así, el programa genera un ranking de interacciones fiables. Luego construye redes genéticas cada vez más complejas. Este proceso mejora la interpretación biológica.
Mejora la predicción de supervivencia
El equipo analizó cánceres como mama o colon. También estudió pulmón, estómago y melanoma. Los resultados fueron comparables a modelos avanzados de inteligencia artificial.
“Podemos predecir la supervivencia con explicaciones claras”, señala Aitor Oviedo-Madrid. Además, el sistema identifica moléculas relevantes. Esto abre nuevas líneas de investigación clínica.
El software para detectar cáncer también encuentra patrones comunes. Estos patrones aparecen en distintos tumores. Así, ayuda a generar nuevas hipótesis biomédicas.
Una herramienta abierta y con apoyo europeo
RNACOREX está disponible en GitHub y PyPI. Incluye descargas automáticas de bases de datos. Esto facilita su uso en otros laboratorios.
El proyecto cuenta con apoyo del Gobierno de Navarra. También recibe financiación europea a través de ERA PerMed. “Es una alternativa explicable a la caja negra”, destaca Armañanzas.
La Universidad de Navarra ya trabaja en mejoras. Se añadirán nuevas interacciones y rutas biológicas. El objetivo es avanzar en medicina personalizada con software para detectar cáncer.
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